MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.05

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019766	TCT	2	6	1	6	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019766	CAAAA	2	10	45	54	80 %	0 %	0 %	20 %	434408557
3	NC_019766	AT	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	434408557
4	NC_019766	ACT	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
5	NC_019766	T	6	6	365	370	0 %	100 %	0 %	0 %	434408557
6	NC_019766	ATT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
7	NC_019766	ACA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
8	NC_019766	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
9	NC_019766	AGA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
10	NC_019766	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
11	NC_019766	A	6	6	675	680	100 %	0 %	0 %	0 %	434408557
12	NC_019766	AGA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
13	NC_019766	TA	3	6	744	749	50 %	50 %	0 %	0 %	434408557
14	NC_019766	TTA	2	6	761	766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
15	NC_019766	ATCA	2	8	795	802	50 %	25 %	0 %	25 %	434408557
16	NC_019766	ATT	2	6	816	821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
17	NC_019766	AAT	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
18	NC_019766	TAA	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
19	NC_019766	CAC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408557
20	NC_019766	TAA	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
21	NC_019766	TAC	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
22	NC_019766	TGG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
23	NC_019766	TAC	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
24	NC_019766	TAA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
25	NC_019766	ATA	2	6	1194	1199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
26	NC_019766	GCAA	2	8	1222	1229	50 %	0 %	25 %	25 %	434408557
27	NC_019766	ATT	2	6	1248	1253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
28	NC_019766	CAA	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
29	NC_019766	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
30	NC_019766	ACC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408557
31	NC_019766	TGG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
32	NC_019766	TGA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
33	NC_019766	ACA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
34	NC_019766	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
35	NC_019766	GAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
36	NC_019766	TAC	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
37	NC_019766	GAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
38	NC_019766	TTA	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
39	NC_019766	TA	3	6	1734	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	434408557
40	NC_019766	T	6	6	1781	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	434408557
41	NC_019766	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
42	NC_019766	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
43	NC_019766	TGG	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
44	NC_019766	TGA	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
45	NC_019766	TTA	2	6	1990	1995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
46	NC_019766	A	6	6	2062	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	434408557
47	NC_019766	AT	3	6	2071	2076	50 %	50 %	0 %	0 %	434408557
48	NC_019766	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
49	NC_019766	ACA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
50	NC_019766	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	434408557
51	NC_019766	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408557
52	NC_019766	AAC	2	6	2397	2402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
53	NC_019766	GTA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
54	NC_019766	TATT	2	8	2469	2476	25 %	75 %	0 %	0 %	434408557
55	NC_019766	ATT	2	6	2572	2577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
56	NC_019766	AG	3	6	2579	2584	50 %	0 %	50 %	0 %	434408557
57	NC_019766	CAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
58	NC_019766	TTA	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
59	NC_019766	AC	3	6	2667	2672	50 %	0 %	0 %	50 %	434408557
60	NC_019766	TTTA	2	8	2688	2695	25 %	75 %	0 %	0 %	434408557
61	NC_019766	ATG	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
62	NC_019766	CAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
63	NC_019766	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
64	NC_019766	GAA	2	6	2741	2746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
65	NC_019766	A	6	6	2765	2770	100 %	0 %	0 %	0 %	434408557
66	NC_019766	AAG	2	6	2856	2861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
67	NC_019766	TGAGA	2	10	2897	2906	40 %	20 %	40 %	0 %	434408557
68	NC_019766	AAT	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019766	TC	3	6	3016	3021	0 %	50 %	0 %	50 %	434408558
70	NC_019766	CTT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
71	NC_019766	AGG	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408558
72	NC_019766	TACT	2	8	3400	3407	25 %	50 %	0 %	25 %	434408558
73	NC_019766	CTT	2	6	3479	3484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
74	NC_019766	CTT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
75	NC_019766	ATA	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408558
76	NC_019766	GTT	2	6	3625	3630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408558
77	NC_019766	AAC	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408558
78	NC_019766	CGA	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408558
79	NC_019766	ACC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408558
80	NC_019766	TAAAGT	2	12	3752	3763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434408558
81	NC_019766	TCT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
82	NC_019766	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	434408558
83	NC_019766	TCT	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
84	NC_019766	CT	4	8	3934	3941	0 %	50 %	0 %	50 %	434408558
85	NC_019766	CCTG	2	8	3942	3949	0 %	25 %	25 %	50 %	434408558
86	NC_019766	AGT	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408558
87	NC_019766	TCTT	2	8	4023	4030	0 %	75 %	0 %	25 %	434408558
88	NC_019766	ATCC	2	8	4046	4053	25 %	25 %	0 %	50 %	434408558
89	NC_019766	CTG	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408558
90	NC_019766	TTA	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408558
91	NC_019766	AT	3	6	4196	4201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019766	ATC	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019766	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019766	ATA	2	6	4409	4414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019766	GGT	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019766	ATG	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408559
97	NC_019766	AAAGC	2	10	4470	4479	60 %	0 %	20 %	20 %	434408559
98	NC_019766	TAA	2	6	4484	4489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408559
99	NC_019766	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408559
100	NC_019766	CAC	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408559
101	NC_019766	GAA	2	6	4668	4673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408559
102	NC_019766	TC	3	6	4691	4696	0 %	50 %	0 %	50 %	434408559
103	NC_019766	CCA	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019766	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019766	TGA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019766	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019766	T	7	7	4963	4969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019766	A	7	7	4980	4986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019766	ATA	2	6	5002	5007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019766	AAG	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019766	ATCT	2	8	5187	5194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019766	A	6	6	5303	5308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019766	TTAT	2	8	5312	5319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019766	A	6	6	5323	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019766	ATT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019766	CTT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019766	CAA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019766	GTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019766	AATT	2	8	5500	5507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019766	TAA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019766	AAC	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019766	A	6	6	5613	5618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019766	ACA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019766	GTT	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019766	AAC	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019766	ACT	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019766	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019766	CAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.